Il Dottorato di Ricerca è il più alto grado di istruzione previsto nell'ordinamento accademico italiano ed è volto all'acquisizione delle competenze necessarie per esercitare attività di Ricerca di alta qualificazione presso Università, enti pubblici e soggetti privati.
Il progetto formativo del Dottorato di Ricerca in Scienze Biochimiche e Biotecnologiche dell’Alma Mater Studiorum – Università di Bologna si prefigge di fornire ai giovani laureati in discipline scientifiche una formazione multidisciplinare che possa permettergli di crescere come ricercatori e di raggiungere l’eccellenza nei settori della Biochimica e delle Biotecnologie.
Il Dottorato è proposto dal Dipartimento di Biochimica "G. Moruzzi" con il concorso dei seguenti Dipartimenti dell’Alma Mater Studiorum – Università di Bologna: Farmacologia; Scienze Farmaceutiche; Biologia Evoluzionistica e Sperimentale; Ematologia e Scienze Oncologiche "L.E.A. Sergnoli"; Medicina Interna, dell’Invecchiamento e Malattie Nefrologiche; Scienze e Tecnologie Agro-Ambientali; Chimica Industriale e dei Materiali; Ingegneria Chimica, Minirearia e delle Tecnologie Ambientali; Morfofisiologia Veterinaria e Produzioni Animali.
Il programma formativo prevede attività a tempo pieno e dura tre anni.
Il Dottorato è organizzato in tre curricula tematici: Biochimica, Biotecnologie Cellulari e Molecolari e Biotecnologie Industriali
Il programma formativo offre ai dottorandi attività formative propedeutiche comuni ed una formazione specialistica per ciascuno dei tre curricula. Ogni anno sono previste circa 60 ore per corsi e seminari suddivisi tra insegnamenti e seminari comuni a più dottorati della Scuola di dottorato, seminari o cicli di seminari per lo specifico dottorato tenuti in maggior parte da ricercatori stranieri ed insegnamenti mutuati da corsi di laurea magistrale o da master. Infine, ai dottorandi verrà offerta la possibilità di partecipare a Summer o Winter School internazionali, su tematiche inerenti il loro progetto formativo.
Il Dottorato ha lo scopo di formare ricercatori di elevata professionalità e con una solida preparazione, capaci di progettare e condurre ricerche nei settori della biochimica e delle biotecnologie. Gli studenti del Dottorato approfondiranno le conoscenze di processi biologici e biochimici complessi in tessuti umani, animali o vegetali e a livello cellulare e molecolare sia in condizioni normali sia patologiche; impiegheranno le più avanzate metodologie, inclusi approcci bioinformatici e biocomputazionali, per lo studio di sistemi viventi o loro prodotti nativi o da DNA ricombinante nei diversi ambiti della biochimica e delle biotecnologie e per lo sviluppo di tecnologie delle fermentazioni e dell’impiego di enzimi e cellule microbiche nei processi di bioconversione. Il Dottorato è organizzato in tre curricula tematici: Biochimica, Biotecnologie Cellulari e Molecolari e Biotecnologie Industriali ed il carattere che lo contraddistingue è l’interdisciplinarietà e la trasversalità delle aree di ricerca coinvolte. Lo studente dovrà acquisire la capacità di impostare e condurre in maniera del tutto autonoma una ricerca in una delle discipline individuate dai diversi curricula sopra indicati, con particolare attenzione all’applicabilità dei risultati scientifici ottenuti sia in ambito industriale sia in strutture di ricerca. La finalità, infatti, è quella di facilitare l’inserimento professionale dei dottori di ricerca in aziende che si occupano di problematiche legate alla biologia ed alla biochimica, di ricerche di base ed applicate nei settori delle biotecnologie ed in attività produttive e di servizio nell’ambito della salute, della produzione agroalimentare e zootecnica, della tecnologia delle fermentazioni e dei processi industriali. Inoltre, i dottori di ricerca saranno in grado di operare nel settore dell’alta formazione.
Il dottorando dovrà svolgere a tempo pieno, sotto la guida di un tutor e la supervisione del Collegio, attività di ricerca in una delle discipline individuate dai diversi curricula tematici, volta allo sviluppo di un progetto che sarà oggetto della tesi. La presentazione periodica dei risultati ottenuti dai dottorandi nello svolgimento della ricerca sarà incentivata con incontri che ne accertino in itinere le conoscenze ed abilità, la partecipazione a congressi nazionali ed internazionali e a corsi tematici. Sono altresì previsti stage presso laboratori di ricerca pubblici e privati per completare la formazione dei dottorandi anche con l’utilizzo di grandi strumentazioni internazionali e favorirne il futuro inserimento nel mondo del lavoro. Infine, i dottorandi potranno svolgere una limitata attività didattica integrativa in corsi ufficiali dell’Ateneo di Bologna.
Il Dottorato incentiva un soggiorno in centri di ricerca o industrie estere per i dottorandi e prevede per i borsisti l’obbligo di un periodo di formazione all’estero per almeno 6 mesi.
Per promuovere gli scambi internazionali, ricercatori stranieri terranno seminari o cicli di seminari ai dottorandi in lingua inglese.
Per promuovere la partecipazione di studenti stranieri un estratto del bando, tradotto in inglese, sarà trasmesso per e-mail alle principali Università europee che hanno corsi in Biochimica e/o Biotecnologie e saranno promossi scambi di dottorandi con le sedi straniere con le quali si intrattengono contatti e che già ospitano o hanno ospitato nostri dottorandi. Si è già siglato un accordo per lo scambio di studenti con il Beijing Institute of Technology (BIT) di Pechino. Inoltre, scambi, in ambito di progetti Erasmus, sono attivi con l’Università Pompeu Fabre di Barcellona, l’Università di Stoccolma, l‘Università Pablo de Olavide di Siviglia, l’Università Koch e l’Università Sabanci di Istanbul, l’Università di Louvain e l’Università di Pamplona. Infine sono in essere accordi con l’Institute for Computational Biology - Shanghai Institutes for Biological Sciences Chinese Academy of Sciences.
Per gli studenti stranieri potranno essere organizzati corsi di apprendimento della lingua italiana.
Il Dottorato prevede il rilascio di titolo congiunto con Istituzioni estere nell’ambito di convenzioni di Cotutela ed il rilascio del titolo di "Doctor Europaeus".
I progressi della ricerca di base in ambito biochimico e biotecnologico, associati alla necessità di una impostazione interdisciplinare delle problematiche scaturite in vari settori, hanno contribuito all’applicazione delle biotecnologie in vari settori trainanti dell'economia. Al di là delle conoscenze di base che possono scaturire da ricerche biochimiche e biotecnologiche, vi sono un numero sempre crescente di applicazioni in ambito farmaceutico e sanitario, un'area tra le prime a beneficiare dell'impatto delle biotecnologie. Altre aree rilevanti sono quelle agroalimentare e zootecnica, microbiologica e dei processi ed impianti industriali dove le biotecnologie mirano allo sviluppo di sistemi produttivi basati sull’impegno di microrganismi ed all’ottimizzazione e gestione di processi molecolari e biochimici, volti anche alla protezione dell’ambiente.
L’organizzazione interdisciplinare e le tematiche proposte dal dottorato forniscono ai dottorandi una formazione spendibile in uno o più dei settori sopra elencati.
Il Collegio del Dottorato comprende docenti di dieci Dipartimenti ove sono condotte attività di ricerca nei settori della Biochimica e delle Biotecnologie, suddivisi in tre curricula tematici: Biochimica, Biotecnologie Cellulari e Molecolari e Biotecnologie Industriali.
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Flavio Flamigni
Linee di ricerca:
- Studio della trasduzione del segnale e dei meccanismi biochimici coinvolti nel controllo della crescita, differenziamento e morte cellulare, in condizioni correlabili a contesti patologici come l'artrosi e le patologie cardiache. Vengono investigati in questo ambito il metabolismo e la funzione delle poliamine alifatiche e l’effetto di fattori nutrizionali e nutraceutici.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/flavio.flamigni
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Carlo Guarnieri
Linee di ricerca:
- Rigenerazione del miocardio infartuato mediante stimolazione di cellule staminali da microsfere biomimetiche.
- Studi focalizzati sulla vitalità cellulare e apoptosi in cellule staminali mesenchimali ed sugli adattamenti metabolici all’ipossia.
- Formazione in vitro di pseudo-tessuto muscolare cardiaco mediante stimolazione bio-meccanica di supporti polimerici con cellule staminali cardiache. Sito: http://www.unibo.it/docenti/carlo.guarnieri
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Stefano Iotti
Linee di ricerca:
- Sviluppo di chemosensori fluorescenti per cationi metallici intracellulari.
- Analisi del magnesio nella genesi della farmaco-resistenza in cellule tumorali con microscopia confocale a due fotoni, citofluorimetria, microfluorescenza a raggi X.
- Sviluppo di modelli matematici per la valutazione termodinamica dei tessuti in vivo.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/stefano.iotti
Responsabile gruppo di ricerca: Prof.ssa Silvana Hrelia
Linee di ricerca:
- Studi su nutraceutici e peptidi bioattivi di origine vegetale per la prevenzione e contenimento di patologie cronico-degenerative: validazione dei claim funzionali attraverso test in vitro e studi di intervento sull’uomo.
- Biomarcatori dello stress ossidativo, modulazione da parte di componenti nutraceutici e da agenti stressori ambientali: studi "in vivo" nell’uomo e nell’animale da esperimento.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/silvana.hrelia
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Giancarlo Solaini
Linee di ricerca:
- Valutazione dell'ipossia e della proteina beta-amiloide su cellule nervose per definirne la rilevanza nella patogenesi e/o progressione della malattia di Alzheimer.
- Effetti dell’ipossia acuta e cronica di cellule trasformate e non per definire come il mitocondrio sia coinvolto nei meccanismi di adattamento cellulare alla bassa disponibilità di ossigeno e nell’induzione della morte cellulare.
- Approcci quantitativi per i metaboliti cerebrali rilevabili con NMR.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/giancarlo.solaini
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Vitaliano Tugnoli
Linee di ricerca:
- Alterazioni metaboliche in neoplasie umane di diverso tipo e grado istologico studiate mediante spettroscopia di risonanza magnetica nucleare ex vivo e in vivo.
- Effetti della supplementazione di acidi grassi polinsaturi sul metabolismo del colesterolo in cardiomiociti di ratto.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/vitaliano.tugnoli
Responsabile gruppo di ricerca: Prof.ssa Natalia Calonghi
Linee di ricerca:
- Ruolo dei recettori degli estrogeni nel carcinoma ovarico. La ricerca si focalizza sulle modificazioni molecolari e biochimiche indotte da un nuovi derivati indolici in grado di indurre, nel carcinoma ovarico, effetti citostatici ma non citotossici.
- Caratterizzazione di inibitori dell’HDAC1, con particolare approfondimento del complesso tra HDAC1/ciclina D1, quali potenziali farmaci antitumorali.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/natalia.calonghi
Responsabile gruppo di ricerca: Prof.ssa Rita Casadio
Linee di ricerca:
- Studi di bioinformatica volti alla caratterizzazione della struttura di proteine e di sequenze di geni coinvolti in processi neoplastici o nell’insorgenza di patologie neurodegenerative. In particolare: Genome annotation; SNPs calling and annotation; protein misfolding and its relation to human diseases.
Sito: http://www.biocomp.unibo.it
Responsabile gruppo di ricerca: Prof.ssa Monica Forni
Linee di ricerca:
- Sviluppo di modelli "ex vivo" ed "in vivo" per lo studio di molecole ad azione antiproliferativa per il controllo dell’iperplasia neointimale, per lo studio di polimeri di adesione come veicoli di farmaci ad azione protettiva della mucosa esofagea o di biomateriali odontoiatrici.
- Modelli transgenici nel suino per lo studio del rigetto iperacuto.
- Modelli preclinici di terapia genica per malattie degenerative della retina.
- Studio dell’espressione genica di biomolecole che regolano l’appetito ed il ritmo sonno veglia nel suino.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/monica.forni
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Giorgio Gallinella
Linee di ricerca:
- Sviluppo di dispositivi "lab on chip" per la diagnosi di infezioni virali, basati su amplificazione di acidi nucleici e tecniche di ibridazione molecolare.
- Analisi di espressione genica tramite array di oligonucleotidi e PCR per lo studio di interazioni virus-cellula in modelli di interesse clinico.
- Sviluppo di sistemi per la produzione di virus ricombinanti e loro caratterizzazione funzionale.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/giorgio.gallinella
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Andrea Masia
Linee di ricerca:
- Si interessa di qualità della frutta nei suoi aspetti biochimici e di stress ossidativo indotto da stress abiotici. Ossido nitrico in piante clorotiche per suoli calcarei.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/andrea.masia
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Santi Spampinato
Linee di ricerca:
- Esplorazione della funzione e regolazione del genoma nel contesto della formazione e progressione di neoplasie o nel differenziamento neuronale al fine di studiare nuovi farmaci che modulano l’attività istonica e/o regolano specifici fattori di trascrizione.
- Impiego delle biotecnologie farmacologiche per il drug discovery: analisi di nuovi ligandi antagonisti delle integrine ed agonisti oppioidi.
Sito: http://www.spampinatolab.unibo.it
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Roberto Tuberosa
Linee di ricerca:
- Si applicano approcci di genetica diretta (forward genetics) ed inversa (reverse genetics) per identificare e clonare loci (geni e QTL) di interesse agronomico in frumento dure, orzo e mais. I caratteri oggetto di studio sono la resistenza alle fitopatie fungine e le caratteristiche morfo-fisiologiche in grado di influenzare la resistenza alla siccita'.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/roberto.tuberosa
Responsabile gruppo di ricerca: Prof.ssa Patrizia Brigidi
Linee di ricerca:
- Microbiota intestinale ed invecchiamento. Analisi di regimi alimentari per studiare l’interazione dieta/ microbiota/ healthy ageing.
- Analisi molecolare dell’interazione fra microbiota ed epitelio intestinale umano o ecosistema vaginale utilizzando approcci di proteomica, immuno-microscopia a fluorescenza e qPCR.
- Isolamento di nuovi ceppi probiotici con proprietà immuno-modulanti per sviluppare functional foods.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/patrizia.brigidi
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Fabio Fava
Linee di ricerca:
- Studio di processi di dealogenazione di policlorobifenili in sedimenti marini contaminati con allestimento di microcosmi a fase slurry e loro monitoraggio chimico, microbiologico e biologico-molecolare integrato.
- Sviluppo di bioreattori a biomassa adesa per la rimozione di solventi clorurati da acqua di falda contaminata e di microrganismi e di processi per la produzione biotecnologica da sottoprodotti dell'agro-industria.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/fabio.fava
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Alejandro Hochkoeppler
Linee di ricerca:
- Studi strutturali e funzionali della DNA polimerasi III di Escherichia coli - Nel nostro laboratorio è stato costruito un sistema di co-espressione che ha permesso la sovraespressione e purificazione del core catalitico della DNA polimerasi III di Escherichia coli. Sono in corso studi riguardanti la cinetica dell’enzima ed i rapporti funzionali/strutturali tra le sue diverse subunità.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/a.hochkoeppler
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Franco Magelli
Linee di ricerca:
- Ottimizzazione del processo di produzione di metano ed idrogeno in bioreattori a biomassa sospesa o adesa di configurazione innovativa.
- Ottimizzazione di processi di decontaminazione biologica di acque reflue e terreni da composti organici.
- Ottimizzazione del processo di produzione di alghe ad elevato contenuto lipidico in fotobioreattori di configurazione innovativa.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/franco.magelli
Responsabile gruppo di ricerca: Prof. Leonardo Setti
Linee di ricerca:
- Sviluppo di processi enzimatici di bioraffinazione da matrici di scarto agro-alimentare per il recupero di chemical building blocks e alla produzione di ingredienti per il settore cosmetico e alimentare.
- Sviluppo di bioelettrodi multifunzionali per la realizzazione di biosensori plastici di terza generazione e di biofuel cell plastiche per il recupero di energia elettrica da biomasse di scarto.
Sito: http://www.unibo.it/docenti/leonardo.setti
Per avere ulteriori informazioni sulle tematiche del Dottorato e sulle modalità di ammissione si può contattare il Prof. Santi Spampinato - Coordinatore del Dottorato.
E-mail: santi.spampinato@unibo.it